Micron Document
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Senso (biologia molecolare)
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In mwcqbiochimica, il concetto di mwcgsenso si riferisce all'orientamento estremità-estremità di un singolo filamento di mwcwacido nucleico. Le convenzioni di nomenclatura degli anelli di zucchero contenuti nei mwdqnucleotidi hanno come diretta conseguenza la presenza di mwdgestremità 5′ ed mwdw estremità 3′. Le posizioni relative di strutture a cavallo del filamento (mweageni, mweqfattori di trascrizione o mwegpolimerasi) sono solitamente definite come mwewa monte (verso l'estremità 5' del filamento) o mwfaa valle (verso l'estremità 3').

L'importanza di una tale modalità di nomenclatura appare evidente se si pensa al fatto che, mwfgmwfwin vivo, l'unica modalità di sintesi di un acido nucleico segue il senso 5′ → 3′, dal momento che la mwgapolimerasi è in grado di attaccare un nucleotide solo all'mwgqossidrile presente al 3'.

Tradizionalmente, le sequenze di mwgwDNA ed mwhaRNA sono scritte in senso 5′ → 3′.

Contents


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Estremità 3′

L'estremità 3′ (pronuncia: mwjatre primo) di un filamento è così nominata perché termina con l'ossidrile in posizione 3 dell'anello di furanosio. Il 3′-ossidrile (o 3′-OH) è necessario per la sintesi di nuove molecole di acido nucleico, dal momento che può essere mwjqmwjgligato al 5′-fosfato di un nucleotide appartenente ad un altro filamento, favorendo così l'unione dei due filamenti.

In biologia molecolare è possibile utilizzare nucleotidi privi di 3'-OH (mwkadideossiribonucleotidi) per interrompere la replicazione del DNA. Tale tecnica, nota come mwkqmetodo del dideossi, è utilizzata per il mwkgsequenziamento del DNA attraverso il metodo di Sanger.

L'estremità 3′ è anche il sito di mwlqpoliadenilazione degli mwlgmRNA.

Estremità 5′

L'estremità 5′ (pronuncia: mwmqcinque primo) di un filamento è così nominata perché termina con il gruppo chimico situato presso il carbonio in posizione 5 dell'anello di furanosio. Se a tale carbonio è legato un gruppo fosfato, è possibile la mwmgligazione con l'estremità 3'-OH di un altro nucleotide. Se il fosfato non è presente, essa non può invece avvenire. In biologia molecolare si utilizzano le mwmwfosfatasi per rimuovere i fosfati presenti all'estremità 5' ed evitare indesiderate ligazioni.

L'estremità 5′ è il sito presso cui avviene l'aggiunta di 7-metil guanosina attraverso un inusuale legame 5'-5'. Tale evento, noto come mwngcapping, protegge il mRNA dalla degradazione mediata da mwnwesonucleasi. --

Bibliografia

• mwow(EN) Lodish et al., Molecular Cell Biology, 5ª ed., New York, W.H. Freeman and Company, 2004, ISBN 0-7167-4366-3.